Năm 2009, công tác y tế dự phòng Thừa Thiên Huế đã nhận được sự quan tâm chỉ đạo và tạo điều kiện thuận lợi của lãnh đạo tỉnh và Bộ Y tế, sự quyết tâm của toàn ngành và ủng hộ tích cực của các đơn vị phối hợp, đạt được nhiều kết quả đáng ghi nhận: Các chương trình mục tiêu quốc gia phòng chống một số bệnh xã hội, bệnh dịch nguy hiểm, tiêm chủng mở rộng đề đạt và vượt chỉ tiêu. Chủ động phòng chống kịp thời, có kết quả các bệnh truyền nhiễm có khả năng gây dịch, đặc biệt là đã kịp thời ngăn chặn dịch cúm A(H1N1) với các giải pháp hiệu quả như tổ chức điều trị tại cộng đồng có kiểm soát, tăng cường kiểm tra giám sát, trực gác 24/24, phối hợp tốt với Sở Giáo dục - Đào tạo, Sở Công Thương, Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch,…Đẩy mạnh triển khai chương trình dinh dưỡng. Tỷ lệ suy dinh dưỡng trẻ em dưới 5 tuổi giảm xuống dưới 17% đạt chỉ tiêu đề ra.

Năm 2010, năm có nhiều lễ hội lớn và dự báo có nhiều khó khăn, ngành y tế không chủ quan trước kết quả đã đạt được, quyết tâm cao tập trung đầu tư nguồn lực, phát huy thế mạnh trình độ của đội ngũ xây dựng Trung tâm y tế dự phòng Thừa Thiên Huế trở thành trung tâm của khu vực miền Trung; tích cực chủ động phòng chống dịch, tăng cường công tác kiểm tra giám sát ở cơ sở; đẩy mạnh phong trào làng sức khỏe, gia đình sức khỏe; đảm bảo an toàn vệ sinh phòng dịch phục vụ các lễ hội và trước mắt là phục vụ nhân dân đón tết cổ truyền Canh Dần.