Đảng ủy bộ phận Trung tâm Y tế Dự phòng được thành lập theo quyết định số 24-QĐ/ĐUYT ngày 27 tháng 4 năm 2012. Đảng ủy bộ phận Trung tâm Y tế Dự phòng có 3 chi bộ với 31 Đảng viên; Ban chấp hành lâm thời Đảng bộ bộ phận gồm 7 đồng chí, Bí thư Đảng ủy lâm thời là đồng chí Nguyễn Đình Sơn- Giám đốc Trung tâm y tế dự phòng,  trong đó 3 Chi bộ liên khoa gồm: Phòng Hành chính Tổ chức – Kế hoạch Tài chính – Khoa Kiểm dịch Y tế; Nội tiết – Sức khỏe cộng đồng – Kiểm soát các bệnh truyền nhiễm và Vắc xin sinh phẩm; Xét nghiệm - Sức khỏe nghề nghiệp – Dinh dưỡng và Cộng đồng.
Đảng ủy bộ phận Trung tâm Y tế Dự phòng là Đảng ủy bộ phận đầu tiên của ngành y tế Thừa Thiên Huế.